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戰疫情,首版“新型冠狀病毒基因組數據分析綜合平臺”免費向科研人員開放

攜三代測序和生物云平臺為疫情抗擊免費提供技術支持,百邁客在行動!

 

新型冠狀病毒疫情對我國人民的生產生活產生了較大影響,牽動著大家的心。舉國上下都十分重視,我們的一線醫護人員沖在了抗擊疫情的最前線,大家也都從各方面提供著各種援助,充分體現了我們一方有難八方支援的優良傳統。

作為一種新型冠狀病毒,我們對它的了解還不夠,我們的臨床科學家們也在想盡各種辦法加班加點研究這種新型冠狀病毒,以便盡快研究清楚它的生物學分子機理,正如1月26日,在國務院新聞辦疫情新聞發布會上,中國疾病預防控制中心主任高福院士表示的,要結合多種技術手段來幫助做病毒的解析。百邁客作為三代測序和生物云服務提供商,結合自身的技術特點,也積極的參與到抗擊疫情的戰斗中,用自己的技術為抗擊疫情貢獻一份力量。

針對此次疫情,百邁客積極與一線的醫護和科研人員合作,結合一線的需求,積極調動各種資源,經過十幾天夜以繼日的開發,終于把第一版新型冠狀病毒(nCov)基因組數據庫分析平臺上線,為我們的一線科研人員提供免費服務。現把階段性開發進展和支持方式公布如下,希望對加快破解和管控疫情提供有效支撐:

1?“病毒數據庫&自動化分析平臺/工具” 向社會免費共享

自2019年12月疫情首現以來,百邁客研發團隊及時跟進疫情研究進展。目前已完成一期研發計劃,我們通過對各數據庫中的新型冠狀病毒數據進行合理整合分析,及時搭建了首版“新型冠狀病毒數據庫分析平臺”(http://ncovdb.biocloud.net/home) ,本數據庫于2020年1月27日20:00時正式上線。本數據庫將配合國家公共資源數據庫為社會提供更全面、及時、準確的數據資源。

數據庫部署了31個新型冠狀病毒基因組序列,其中MN938384、MN908947、MN975262等菌株均已補充詳細的基因組、編碼基因及蛋白序列信息,我們還基于這31個菌株,2株MERS作為外源構建了物種進化樹,以便更清晰解讀新型冠狀病毒的進化樹起源。研究人員可便捷下載基因組數據資源,亦可通過我們部署的Blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相關的初步數據分析、挖掘。
我們將持續跟進、并更新該數據庫,為國內外科研工作者提供方便快捷的數據檢索及下載服務。在隨后的二期、三期研究計劃中,我們會繼續部署各種自動化分析工具,分析保守域、菌株間的變異信息,尋找菌株間的共性的突變信息,為病毒致病機理的研究、疫苗的開發等提供技術支持。

2三代納米孔技術助力病毒變異監測

三代測序技術作為基因組學研究的新興技術,對病毒的組學研究有著重要作用,作為全球領先的三代測序技術服務提供商,百邁客生物與戰略合作伙伴Oxford Nanopore公司聯合協調了5套MinION測序平臺及配套試劑盒,各位疫情防控專家如有需求,聯系評估后隨時無償配發,保證前線專家做好對疫情的實時監控、及時分析;如有建好的2019-nCov病毒測序文庫也可以結合送樣要求,聯系我們。
附錄:樣品要求

3、已配備專業生物信息分析團隊,并向社會無償提供信息分析技術支持
疫情爆發以來,我們組織20余人的生信分析團隊提前結束假期,不斷針對發布的病毒基因組進行研究分析,隨時待命加入抗擊疫情的隊伍。同時,百邁客亦誠懇邀請、歡迎各位專家學者共同探討疫情防控良策,請聯系18514282648(微信同號)進群討論。

4、其它可調配資源
如果前線專家需要其它生物技術支持資源,百邁客生物將不遺余力提供最大的幫助。

 

24小時對接聯系人:

I.數據庫使用&數據分析對接人:王老師

手機:18514282648(同微信)郵箱:[email protected]

II.樣品準備&測序對接人:康老師

手機:16622926288(同微信)郵箱:[email protected]

我們將全力協調公司各種資源,在基因組變異與進化,病毒感染與致病機理分析,病毒溯源等方面為國為民貢獻一份“微薄”之力,在生命的賽道上,分秒必爭!疫情防控無小事,從你我做起。

 

加油武漢!加油中國!
百邁客生物
2020年1月27日
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